El Colegio Juanita Fernández es un establecimiento católico, científico humanista, fundado el año  2001 por el Padre Kepa Bilbao Laca.

Comienza con una matrícula superior a los 300 alumnos desde Párvulos a Octavo año básico. En un primer momento se contaba sólo con cuatro salas de clases y  servicios higiénicos. Se arrendaron dos casas, donde se instalaron las oficinas administrativas y el Kínder.

Durante este primer año los trabajos de construcción continuaron su curso, considerando que la meta para el  próximo año era iniciar la Educación Media.  Así  fue posible que al iniciarse el año 2002, se entregó el segundo piso, donde fue posible albergar a más alumnos. También en este año se incorpora el Colegio a la Jornada escolar completa, desde Séptimo básico a Primero medio.

Durante los años siguientes, el establecimiento creció en forma acelerada en el número de cursos y matrícula. Asimismo, la infraestructura fue creciendo paulatinamente, pudiendo hoy en día contar con todos los niveles desde Pre-Kínder a Cuarto medio y con mayores instalaciones que contribuyen al proceso de formación de los alumnos.